Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms