Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms