Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdcQ9QW08 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms