Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP5

Hapln1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln1Q9QUP5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hapln1Q9QUP5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hapln1Q9QUP5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hapln1Q9QUP5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hapln1Q9QUP5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hapln1Q9QUP5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hapln1Q9QUP5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln1Q9QUP5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms