Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms