Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkd2l2Q9JLG4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms