Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tgm1Q9JLF6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgm1Q9JLF6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms