Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upk3aQ9JKX8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upk3aQ9JKX8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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