Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms