Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AtrQ9JKK8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms