Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms