Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ybx3Q9JKB3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms