Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms