Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms