Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms