Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms