Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus3Q9JI38 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms