Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3bQ9JHJ5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms