Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI0

Mmp19, Matrix metalloproteinase-19, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp19Q9JHI0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp19Q9JHI0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp19Q9JHI0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms