Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim39Q9ESN2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim39Q9ESN2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim39Q9ESN2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim39Q9ESN2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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