Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtofQ9ESF1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms