Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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MesdQ9ERE7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MesdQ9ERE7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms