Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms