Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps35Q9EQH3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms