Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r44Q9EQ47 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Vmn1r44Q9EQ47 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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