Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms