Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcg8Q9DBM0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcg8Q9DBM0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcg8Q9DBM0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcg8Q9DBM0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcg8Q9DBM0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcg8Q9DBM0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcg8Q9DBM0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms