Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms