Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms