Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smdt1Q9DB10 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smdt1Q9DB10 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smdt1Q9DB10 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smdt1Q9DB10 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smdt1Q9DB10 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smdt1Q9DB10 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smdt1Q9DB10 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smdt1Q9DB10 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Smdt1Q9DB10 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Smdt1Q9DB10 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Smdt1Q9DB10 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Smdt1Q9DB10 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Smdt1Q9DB10 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smdt1Q9DB10 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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