Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms