Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9DA42 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9DA42 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9DA42 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms