Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms