Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms