Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Subh2bvQ9D9Z7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Subh2bvQ9D9Z7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Subh2bvQ9D9Z7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Subh2bvQ9D9Z7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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