Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cib4Q9D9N5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cib4Q9D9N5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cib4Q9D9N5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cib4Q9D9N5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cib4Q9D9N5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms