Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms