Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6Q9D8P7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms