Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms