Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca1Q9D7Z6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Clca1Q9D7Z6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Clca1Q9D7Z6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Clca1Q9D7Z6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Clca1Q9D7Z6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Clca1Q9D7Z6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca1Q9D7Z6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms