Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d4aQ9D7V1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms