Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms