Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capns2Q9D7J7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capns2Q9D7J7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms