Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Srp19Q9D7A6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms