Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms