Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PudpQ9D5U5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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