Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9D5Q8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D5Q8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms