Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms