Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rsph14Q9D3W1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rsph14Q9D3W1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms