Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms